婦警になったばかりの青来照はデスキラーズの怪人と遭遇する。絶体絶命のピンチとなった時、プリズム星の科学の粋で造られたセイントジュエルの力でプリズムブルーに変身し怪人を倒すのだった。だが、この時から彼女の戦士としての試練が始まる。残る二つのセイントジュエルを必死で探す蛇の女幹部マンバラがプリズムブルー/青来照に襲い掛かる！まだプリズムスリーとして揃わないプリズムブルーは戦いに敗北して肉体を痛めつけられ尋問にあう！人類の未来と仲間を守る一心でプリズムブルー/青来照はボロボロになり、気絶失神を繰り返しながらも、勝機をうかがうが…！？